近日,山西医科大学崔永萍教授领军的科研团队关于食管癌的最新研究成果在Nature系列期刊Nature Communications(IF 12.353)发表题为“Multi-region sequencing unveils novel actionable targets and spatial heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma”的原创文章,揭示了来自同一食管鳞癌患者不同区域的样本中药物靶标或生物标记物的高度异质性,突出了多区域测序对于精确治疗的必要性。
研究人员对来自39例肿瘤样本的185个肿瘤区域和39个匹配的正常样本进行了测序分析,平均测序深度分别达到290×和187×。共检测到11,703个非沉默单核苷酸变异和961个插入缺失变异,每个样本中位数为189个非沉默变异和14个插入缺失,突变数量在个体中差异很大。具有较大肿瘤体积的食管鳞癌个体的突变负荷高于具有较小肿瘤的个体。同时发现通过多区域测序鉴定的个体的突变显著高于单区域分析或来自癌症基因组图谱(TCGA)突变数据的突变。此外还发现有12.8%的ERBB4突变,并且功能实验证明了它的致癌作用;敲低BRCA1/2的表达,显著增加了食管鳞癌细胞对铂类药物的敏感性;5%的个体携带CD274的局部高水平扩增,导致PDL1的大量表达,这类个体可能对免疫检查点阻断更敏感。该研究揭示了食管鳞癌中的高度异质性,确定了ERBB4、BRCA1/2和PD-L1这几个潜在的治疗靶点,并可能为食管鳞癌治疗提供新的策略。
本研究为山西医科大学牵头的全国多中心研究项目,项目的开展得到了北京大学香港科技大学医学中心、中国医学科学院分子肿瘤国家重点实验室、北京大学医学部肿瘤医院、山西省肿瘤医院的合作支持。同时,也得到了国家科技部重点研发项目、国家自然科学基金重点项目、面上项目和青年项目等多个国家级项目的科研基金资助。
文章链接:https://www.nature.com/articles/s41467-019-09255-1
(内容来源:山西医科大学)
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