近日,郑州大学省部共建食管癌防治国家重点实验室、郑州大学第一附属医院王立东教授团队和瑞典乌普萨拉大学陈兴启教授团队合作,在肿瘤癌变分子机制研究领域取得新突破。该研究一反长期聚焦阐明细胞核染色质DNA与肿瘤发生关系研究的思路,发现位于细胞质内的染色质外DNA(Extrachromosomal DNA,ecDNA)与贲门癌关系密切。该研究成果以题为“Focal amplifications are associated with chromothripsis events and diverse prognoses in gastric cardia denocarcinoma”的论文在知名期刊《Nature Communications》发表。省部共建食管癌防治国家重点实验室、第一附属医院赵学科博士、宋昕博士和乌普沙拉大学邢鹏伟博士为共同第一作者,王立东教授和陈兴启教授为共同通讯作者。
该研究对比分析了贲门腺癌和贲门正常组织全基因组测序(WGS)和染色质外环状DNA测序(circle-seq)数据,鉴定出ecDNA扩增子;证实1/3的局灶性扩增为染色体碎裂引起的;WGS中鉴定出大部分扩增子在ecDNA测序中得到验证;发现所有局灶性扩增片段仅发生在癌细胞中。该研究还发现:贲门癌组织ecDNA中ERBB2基因的局灶性扩增和蛋白表达之间存在正相关;对1688例贲门癌组织ERBB2蛋白表达和生存关系分析发现,在生存期大于2年的贲门癌患者中,ERBB2蛋白高表达患者组生存期明显优于阴性表达组;发现其中28例贲门腺癌组织ecDNA基因组的局灶性扩增的频率(78%)与食管鳞癌非常相似(80%),但与远端胃癌明显不同(50%)。
该研究得到了国家科技部重点研发计划、国家自然科学基金和瑞典乌普萨拉大学基金支持。
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