2011年，学校获批国务院学位委员会“服务国家特殊需求人才培养项目——学士学位授予单位开展培养硕士专业学位研究生”试点高校，2017年，获批吉林省学位委员会“硕士学位授予单位立项建设”A类高校。目前，学校建有省级研究生示范课程2门、精品课程2门、案例库2个，有2项研究生教学成果获评省级教学成果奖，有4篇学生学位论文被评为省优秀专业学位论文，研究生累计发表SCI论文31篇、EI论文77篇、获授权或申请发明专利142件。

学校拥有良好的研究生培养条件。学校拥有博导9人、硕导149人、企业导师215人；科技创新团队72个；国家及省部级工程技术类科研平台24个；科技研发基地57个；成果转化平台3个；省校级现代产业学院和研究院4个；省级研究生工作站6个；校企研究生联合培养基地41个。

学校创新并实施“双导、双驱、交叉递进1+1”产教深度融合的研究生培养模式”。为吉林省培养了一大批水利、建筑等行业亟需的高层次应用型人才，吉林省水利行业50%以上的骨干技术人才来自我校毕业生。 

机制1：实施“4×5矩阵式”专业学位研究生培养课程运行机制 聚焦“服务特需”专业学位研究生培养目标，瞄准高水平专业技能和实践创新能力的培养需求，创建“课程基础理论学习、实践Ⅰ、专业方向课程学习、实践Ⅱ等四个阶段和基础、专业基础、专业方向、案例和综合素质等五个课程模块”有机结合的专业学位研究生“4×5矩阵式”课程运行机制。 

机制2：实施校企“五共同”运行机制 实施“五共同”的校企联合培养机制，即共同制定培养方案、开设实践课程、编写教材、建设联合培养基地、指导研究生。实践性强的理论课由企业导师进行教学，每一位研究生均由1名校内导师和1名企业导师共同全程指导。学校导师与企业导师在培养过程中共同起主导作用。学校导师主要承担基础课和专业课的理论教学和校内实践教学；企业教师主要承担专业案例教学和企业实践教学，负责学生在工程技术实践中的能力培养。校企双方导师共同指导学生从企业工程实际中选好课题，共同负责学生论文实施的技术方案，共同指导学生做好课题，完成论文，共同负责学生的论文质量，并协调学生用于论文工作的时间，形成学校和企业对工程硕士研究生培养的“双导师”制。

机制3：实施专业学位研究生培养的质量考核评价运行机制 建立以提升职业能力为导向，以突出工程背景，注重工程素质和工程实践能力培养的专业学位研究生教育质量标准、评价体系和评估制度。在理论课程学习、现场实习实践及学位论文三个环节，依据“卓越工程师培养计划”国家通用标准、行业标准以及国家职业资格考试要求，制定并实施专业学位研究生质量评价标准。

学校聚焦特色鲜明高水平应用型大学的办学目标，瞄准国家经济社会发展战略和吉林省“一主六双”高质量发展战略，依托深厚的基础工业行业背景和优势，实施了“统筹布局、优化结构、强化优势，突出特色，创新交叉”的学科发展战略，构建了整体优化、相互支撑的9大学科群，6个省特色高水平学科全部进入吉林省特色高水平学科中期检查客观评价排名前30%，数量位列吉林省高校第4名，吉林省应用型高校第1名；有11个专业入选中国校友会中国顶尖应用型专业、15个专业入选中国一流应用型专业，入选总数均居全省应用型高校首位。