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| 名次 | 学校名称 | 所在地区 | 进入百强次数 | 2016年排名情况 | |||
| 全国排名 | 办学类型 | 星级排名 | 办学等级 | ||||
| 1 | 北京大学 | 北京 | 14 | 1 | 中国研究型 | 7星级 | 世界知名高水平大学 |
| 2 | 清华大学 | 北京 | 14 | 2 | 中国研究型 | 7星级 | 世界知名高水平大学 |
| 3 | 复旦大学 | 上海 | 14 | 3 | 中国研究型 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 4 | 武汉大学 | 湖北 | 14 | 4 | 中国研究型 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 5 | 浙江大学 | 浙江 | 14 | 5 | 中国研究型 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 6 | 中国人民大学 | 北京 | 14 | 6 | 中国研究型 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 7 | 上海交通大学 | 上海 | 14 | 7 | 中国研究型 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 8 | 南京大学 | 江苏 | 14 | 8 | 中国研究型 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 9 | 国防科学技术大学 | 湖南 | 2 | 9 | 中国研究型 | 7星级 | 世界知名高水平大学 |
| 10 | 中山大学 | 广东 | 14 | 10 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 11 | 吉林大学 | 吉林 | 14 | 11 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 12 | 中国科学技术大学 | 安徽 | 14 | 12 | 中国研究型 | 6星级 | 中国顶尖大学 |
| 13 | 华中科技大学 | 湖北 | 14 | 13 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 14 | 四川大学 | 四川 | 14 | 14 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 15 | 北京师范大学 | 北京 | 14 | 15 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 16 | 南开大学 | 天津 | 14 | 16 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 17 | 西安交通大学 | 陕西 | 14 | 17 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 18 | 中南大学 | 湖南 | 14 | 18 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 19 | 同济大学 | 上海 | 14 | 19 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 20 | 天津大学 | 天津 | 14 | 20 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 21 | 山东大学 | 山东 | 14 | 21 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 22 | 哈尔滨工业大学 | 黑龙江 | 14 | 21 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 23 | 厦门大学 | 福建 | 14 | 23 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 24 | 东南大学 | 江苏 | 14 | 24 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 25 | 北京航空航天大学 | 北京 | 14 | 25 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 26 | 东北大学 | 辽宁 | 14 | 26 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 27 | 重庆大学 | 重庆 | 14 | 27 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 28 | 华东师范大学 | 上海 | 14 | 28 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 29 | 大连理工大学 | 辽宁 | 14 | 29 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 30 | 北京理工大学 | 北京 | 14 | 30 | 中国研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 31 | 华南理工大学 | 广东 | 14 | 31 | 中国研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 32 | 中国农业大学 | 北京 | 14 | 32 | 行业特色研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 33 | 湖南大学 | 湖南 | 14 | 33 | 中国研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 34 | 华中师范大学 | 湖北 | 14 | 34 | 中国研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 35 | 西北工业大学 | 陕西 | 14 | 35 | 中国研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 36 | 兰州大学 | 甘肃 | 14 | 36 | 中国研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 37 | 电子科技大学 | 四川 | 14 | 37 | 行业特色研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 38 | 武汉理工大学 | 湖北 | 14 | 38 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 39 | 中国地质大学 | 湖北 | 14 | 39 | 行业特色研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 40 | 东北师范大学 | 吉林 | 14 | 40 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 41 | 北京科技大学 | 北京 | 14 | 41 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 42 | 中国矿业大学 | 江苏 | 14 | 42 | 行业特色研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 43 | 长安大学 | 陕西 | 11 | 42 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 44 | 北京交通大学 | 北京 | 14 | 42 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 45 | 北京协和医学院 | 北京 | 4 | 45 | 行业特色研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 46 | 南京农业大学 | 江苏 | 14 | 46 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 47 | 西北大学 | 陕西 | 14 | 47 | 区域研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 48 | 华东理工大学 | 上海 | 14 | 48 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 49 | 华中农业大学 | 湖北 | 14 | 49 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 50 | 南京师范大学 | 江苏 | 14 | 50 | 区域特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 51 | 西南交通大学 | 四川 | 14 | 51 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 52 | 西南大学 | 重庆 | 12 | 52 | 区域研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 53 | 中国海洋大学 | 山东 | 14 | 53 | 行业特色研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 54 | 河海大学 | 江苏 | 14 | 54 | 行业特色研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 55 | 解放军信息工程大学 | 河南 | 2 | 55 | 行业特色研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 56 | 南京理工大学 | 江苏 | 14 | 56 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 57 | 哈尔滨工程大学 | 黑龙江 | 14 | 57 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 58 | 暨南大学 | 广东 | 14 | 58 | 区域研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 59 | 云南大学 | 云南 | 14 | 59 | 区域研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 60 | 中国石油大学 | 山东 | 14 | 60 | 行业特色研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 61 | 南京航空航天大学 | 江苏 | 14 | 61 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 62 | 郑州大学 | 河南 | 14 | 62 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 63 | 苏州大学 | 江苏 | 14 | 63 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 64 | 上海财经大学 | 上海 | 14 | 64 | 行业特色研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 65 | 西北农林科技大学 | 陕西 | 14 | 65 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 66 | 中国政法大学 | 北京 | 13 | 66 | 行业特色研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 67 | 合肥工业大学 | 安徽 | 14 | 67 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 68 | 北京邮电大学 | 北京 | 14 | 68 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 69 | 西安电子科技大学 | 陕西 | 14 | 69 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 70 | 第三军医大学 | 重庆 | 2 | 70 | 行业特色研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 71 | 第二军医大学 | 上海 | 2 | 71 | 行业特色研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 72 | 湖南师范大学 | 湖南 | 14 | 72 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 73 | 第四军医大学 | 陕西 | 2 | 73 | 行业特色研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 74 | 华南师范大学 | 广东 | 14 | 74 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 75 | 上海大学 | 上海 | 14 | 75 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 76 | 中南财经政法大学 | 湖北 | 12 | 76 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 77 | 西南财经大学 | 四川 | 11 | 77 | 区域特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 78 | 北京化工大学 | 北京 | 13 | 78 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 79 | 东华大学 | 上海 | 14 | 79 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 80 | 南昌大学 | 江西 | 11 | 80 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 81 | 解放军理工大学 | 江苏 | 2 | 81 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 82 | 中央财经大学 | 北京 | 10 | 82 | 区域特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 83 | 广西大学 | 广西 | 10 | 83 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 84 | 福州大学 | 福建 | 13 | 83 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 85 | 北京工业大学 | 北京 | 14 | 83 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 86 | 陕西师范大学 | 陕西 | 13 | 86 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 87 | 深圳大学 | 广东 | 2 | 87 | 区域研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 88 | 北京林业大学 | 北京 | 14 | 88 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 89 | 中央民族大学 | 北京 | 14 | 89 | 行业特色研究型 | 5星级 | 中国一流大学 |
| 90 | 燕山大学 | 河北 | 12 | 90 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 91 | 对外经济贸易大学 | 北京 | 6 | 90 | 区域特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 92 | 首都师范大学 | 北京 | 8 | 92 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 93 | 浙江工业大学 | 浙江 | 6 | 93 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 94 | 华北电力大学 | 北京 | 10 | 93 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 95 | 华南农业大学 | 广东 | 13 | 95 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 96 | 浙江师范大学 | 浙江 | 1 | 96 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 97 | 安徽大学 | 安徽 | 12 | 97 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 98 | 首都医科大学 | 北京 | 10 | 98 | 区域特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 99 | 江南大学 | 江苏 | 13 | 99 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 100 | 山西大学 | 山西 | 13 | 100 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 101 | 太原理工大学 | 山西 | 11 | 101 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 102 | 河南大学 | 河南 | 7 | 101 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 103 | 东北林业大学 | 黑龙江 | 11 | 101 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 104 | 福建师范大学 | 福建 | 4 | 104 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 105 | 内蒙古大学 | 内蒙古 | 12 | 106 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 106 | 河北大学 | 河北 | 2 | 107 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 107 | 南京工业大学 | 江苏 | 8 | 109 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 108 | 辽宁大学 | 辽宁 | 12 | 110 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 109 | 新疆大学 | 新疆 | 13 | 111 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 110 | 南方医科大学 | 广东 | 8 | 112 | 区域特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 111 | 海南大学 | 海南 | 5 | 114 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 112 | 东北财经大学 | 辽宁 | 3 | 115 | 区域特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 113 | 昆明理工大学 | 云南 | 3 | 116 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 114 | 成都理工大学 | 四川 | 2 | 118 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 115 | 北京中医药大学 | 北京 | 4 | 119 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 116 | 天津医科大学 | 天津 | 2 | 121 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 117 | 中国药科大学 | 江苏 | 3 | 124 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 118 | 湘潭大学 | 湖南 | 4 | 124 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 119 | 江苏大学 | 江苏 | 2 | 126 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 120 | 扬州大学 | 江苏 | 2 | 127 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 121 | 贵州大学 | 贵州 | 7 | 127 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 122 | 西南政法大学 | 重庆 | 3 | 129 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 123 | 河北工业大学 | 河北 | 1 | 130 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 124 | 四川农业大学 | 四川 | 7 | 131 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 125 | 东北农业大学 | 黑龙江 | 2 | 131 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 126 | 大连海事大学 | 辽宁 | 4 | 138 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 127 | 哈尔滨医科大学 | 黑龙江 | 2 | 139 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 128 | 中国医科大学 | 辽宁 | 2 | 143 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 129 | 广西师范大学 | 广西 | 2 | 143 | 专业型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 130 | 延边大学 | 吉林 | 1 | 161 | 区域研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 131 | 上海中医药大学 | 上海 | 1 | 162 | 区域特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 132 | 南京医科大学 | 江苏 | 2 | 162 | 区域特色研究型 | 3星级 | 中国知名大学 |
| 133 | 北京语言大学 | 北京 | 1 | 171 | 行业特色研究型 | 4星级 | 中国高水平大学 |
| 134 | 沈阳农业大学 | 辽宁 | 1 | 190 | 区域特色研究型 | 2星级 | 区域高水平大学 |
| 135 | 辽宁师范大学 | 辽宁 | 1 | 218 | 专业型 | 3星级 | 中国知名大学 |
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